Dans le cadre de la création du pôle muséal, la Ville a entrepris la restauration du musée. Celle-ci comprend trois phases :
Phase 1 (débutée en 2013) : la restauration gros-œuvre du bâtiment
- Toitures et façades (côté rue et côté jardin).
- Mise aux normes et modernisation des équipements techniques (chauffage, détection incendie, installation électrique et éclairage...).
- Couverture de la cour de service par une verrière en connexion avec le nouveau Musée archéologique.
Phase 2 : restauration et réaffectation des anciens communs
- Les écuries deviennent la future boutique des musées.
- L’ancien fenil est transformé en un auditorium modulable en salle pédagogique.
- Les deux pavillons du jardin sont reliés par une verrière pour devenir le futur restaurant du pôle muséal.
Phase 3 (débutée en 2019) : restauration et remise en état des intérieurs
Ces intérieurs (stucs, boiseries, revêtements muraux, marbres...) sont classés au Patrimoine exceptionnel.
Cette 3e phase englobe aussi la nouvelle scénographie.
